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在疫苗的大規模生產中，細胞工廠是一種不可或缺的工具。它占用空間小、污染概率低，還可以借助自動化設備進行操作。病毒載體疫苗生產過程中就用到了這種細胞培養耗材。

病毒載體疫苗就是利用某種病毒作為載體來遞送抗原。以腺病毒載體新冠疫苗為例，就是用一種無害的普通感冒病毒（腺病毒，易感染人類細胞，但不致病，這里用的是人5型腺病毒，Ad5）作為遺傳信息的載體，這個載體是剔除了腺病毒中與 復制相關的基因，通過基因工程技術，將新冠病毒刺突蛋白（S 蛋白）的基因植入進去，S蛋白是保護性抗原基因，重新組裝的病毒進入人體后，人體細胞會復制產生S蛋白，能夠模擬新冠病 毒的自然感染，誘導人體產生相應抗體，從而達到人體免疫的目的。

病毒載體疫苗生產需要經過基因合成、腺病毒載體轉移質粒構建、體外DNA重組、重組腺病毒基因組質粒、細胞轉染、病毒大量培養及純化等流程，其中，細胞工廠主要應用于病毒的大量培養階段。

在使用細胞工廠時要避免酒精或消毒液噴灑到透氣蓋上，酒精或消毒液可能會濕潤疏水濾膜，導致不能透氣影響氣體交換或導致操作時不能平衡壓力。